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科技日?qǐng)?bào)記者 馬愛(ài)平 通訊員 陳旭
近日，中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜花卉研究所分子育種創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)研究獲得接近完整組裝的白菜基因組，揭示白菜著絲粒的快速進(jìn)化特征。相關(guān)研究成果在線發(fā)表在《植物生物技術(shù)》（《Plant Biotechnology Journal》）上。
白菜參考基因組Chiifu?v4.0的著絲粒特征分析。中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜花卉研究所供圖
白菜是世界上栽培歷史最悠久的蔬菜作物之一，是我國(guó)栽培面積最大的葉用蔬菜。作為蕓薹屬作物中第一個(gè)完成基因組測(cè)序的物種，白菜參考基因組為白菜作物的基因組研究和遺傳改良奠定重要基礎(chǔ)。但是，目前的白菜參考基因組仍然存在幾百個(gè)缺口，其10條染色體的著絲粒結(jié)構(gòu)組裝均不完整。
該團(tuán)隊(duì)利用三代測(cè)序技術(shù)，獲得接近完整的白菜基因組。該基因組填補(bǔ)了白菜基因組中絕大多數(shù)缺口，完成了8條染色體從端粒到端粒的完整組裝，僅有2條染色體仍存在一個(gè)缺口；該基因組是目前組裝最為完整的白菜基因組。研究還發(fā)現(xiàn)著絲粒區(qū)域長(zhǎng)末端重復(fù)序列的平均插入時(shí)間為14萬(wàn)年，顯著晚于泛著絲粒區(qū)域，表明白菜的著絲粒區(qū)域經(jīng)歷著快速進(jìn)化。
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