• <bdo id="qgeso"></bdo>
        • <strike id="qgeso"></strike>
        • <sup id="qgeso"></sup><center id="qgeso"></center>
        • <input id="qgeso"></input>

          規(guī)模宏大的豬腸道微生物基因集、組科研成果面世 提供重要的擴展資源

          首頁 > 探索 > > 正文

          日期:2021-02-19 09:30:36    來源:科技日報    

          2月17日,由中國科學院院士黃路生領(lǐng)銜的江西農(nóng)業(yè)大學科研團隊在國際頂級學術(shù)期刊《Nature Communications 》發(fā)表重大科研成果,提供了目前為止國際上規(guī)模最為宏大的豬腸道微生物基因集和基于宏基因組組裝的基因組。該成果的面世,為豬腸道微生物組相關(guān)研究提供了重要的擴展資源。

          家豬是人類食用的主要肉類,同時還是生物醫(yī)學研究的動物模型。豬的胃腸道中有數(shù)萬億細菌,它們在宿主的新陳代謝、免疫甚至行為中起著至關(guān)重要的作用。在腸道菌群與豬重要經(jīng)濟性狀的因果關(guān)系研究中,其參考基因以及高質(zhì)量的微生物基因組,是了解特定微生物的功能作用及其量化必不可少的資源,但在目前的數(shù)據(jù)庫中,只有部分微生物的基因組及相關(guān)功能基因的注釋信息,約40–50%的腸道微生物缺乏參考基因組。

          據(jù)了解,與易受偏倚,敏感性低以及腸道微生物組缺乏功能性信息的16S rRNA基因測序相比,宏基因組測序可用于推斷微生物群落的生物學功能,并已逐漸用于基于宏基因組關(guān)聯(lián)分析挖掘腸道微生物組與宿主表型之間關(guān)聯(lián)的相關(guān)研究中。但使用目前常用的組裝方法進行宏基因組測序數(shù)據(jù)分析時,可能會產(chǎn)生錯配和嵌合重疊群,并將明顯的偏倚引入結(jié)果。因此,迫切需要完整的微生物基因目錄和參考基因組序列信息來研究腸道微生物組。

          黃路生院士團隊采集了不同年齡、性別、品種、地理區(qū)域、不同腸道部位和不同野豬來源的500個樣本,進行深度宏基因組測序,并整合了現(xiàn)有的豬腸道菌群基因組,構(gòu)建整合了豬腸道微生物基因目錄(PIGC),其中包含來自787個腸道元基因組的17,237,052個完整基因,它們以90%的蛋白質(zhì)同一性聚類,其中28%是未知蛋白質(zhì)。與此同時,通過采用分箱分析模式,構(gòu)建了6339個基于宏基因組組裝的微生物基因組(MAG),它們被聚集成2673個物種級別的基因組倉,其中超過86%為當前數(shù)據(jù)庫中沒有可用的基因組序列。

          在這項研究中,黃路生院士及江西農(nóng)業(yè)大學首席教授陳從英帶領(lǐng)團隊使用構(gòu)建的PIGC和MAG,比較了野豬和高度商業(yè)化杜洛克豬腸道微生物組之間的差異,發(fā)現(xiàn)兩者之間腸道菌群組成差異顯著,為從腸道菌群角度分析野豬抗逆性和商業(yè)豬種高生長速度、高飼料利用提供初步參考數(shù)據(jù),尤其是野豬腸道菌群樣品以及空腸、回腸和盲腸內(nèi)容物樣品的使用,極大地增強了PIGC和MAG的廣泛代表性。(通信員 高蕓 記者 寇勇)

          關(guān)鍵詞: 豬腸道微生物基因集

          下一篇:哺乳動物胚胎發(fā)育學科組在干細胞基因組穩(wěn)定性調(diào)控機制研究中取得重要進展
          上一篇:中國人群腸道宏基因組研究 科學家揭示腸道菌群的性別、年齡特征

          科技

           
          国产三级日本三级日产三级66,五月天激情婷婷大综合,996久久国产精品线观看,久久精品人人做人人爽97
          • <bdo id="qgeso"></bdo>
              • <strike id="qgeso"></strike>
              • <sup id="qgeso"></sup><center id="qgeso"></center>
              • <input id="qgeso"></input>
                主站蜘蛛池模板: 欧美大香线蕉线伊人久久| 黑人粗大猛烈进出高潮视频 | 中国一级全黄的免费观看| 阿v视频在线观看| 日韩在线一区视频| 国产内射大片99| 久久国产亚洲电影天堂| 韩国xxxx69| 日日干夜夜操s8| 四虎1515hm免费国产| 一级毛片恃级毛片直播| 粉色视频午夜网站入口| 天堂资源wwww在线看| 亚洲精品人成电影网| 800av我要打飞机| 欧美伊人久久大香线蕉综合| 国产精品久久国产精品99| 亚州春色校园另类| 青青青国产在线观看| 成年免费视频黄网站在线观看 | 亚洲av无码一区二区三区不卡| 色偷偷8888欧美精品久久| 最新国产精品精品视频| 国产偷国产偷亚洲高清在线| 久久99国产一区二区三区| 精品无码中文视频在线观看| 好湿好紧好痛a级是免费视频| 人人妻人人澡人人爽人人dvd| 91九色蝌蚪porny| 最近日本免费观看直播| 国产亚洲成AV人片在线观看| 中文字幕在线久热精品| 男男chinese同志gay露脸飞机| 在线精品日韩一区二区三区| 亚洲午夜爱爱香蕉片| 高h视频在线观看| 怡红院av一区二区三区| 亚洲精品韩国美女在线| 性刺激久久久久久久久| 日本xxxx高清在线观看免费| 免费看一级黄色毛片|