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天天微資訊!研究揭示衰老細胞基因組全景觀變化

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日期:2022-10-24 18:22:51    來源:科技日報    


(資料圖片)

通訊員 王蕾 科技日報記者 代小佩

近日,首都醫科大學宣武醫院王培昌教授團隊在《Nucleic Acids Research》在線發表研究論文。該研究首次系統揭示衰老階段的全基因組變化景觀,識別在體內負責轉錄時間調控的關鍵元素,從而為衰老分子機制的解析提供了新方向,也為衰老及其相關的疾病干預和治療提供了新思路。

細胞衰老發生在整個生命過程中,在各種生理過程中可以發揮有益作用,包括胚胎發育、組織修復和腫瘤抑制。與此同時,隨著年齡增長,衰老細胞在相關組織或器官中穩定積累也會產生不良后果,這可能會導致組織器官衰老和與衰老相關疾病的發生。

在過去的幾十年里,許多表觀遺傳學研究聚焦于細胞衰老,致力于探索衰老細胞的識別新途徑、衰老細胞的新表征和消除衰老細胞的新方法。當細胞衰老發生時,屈服于多因子應激的細胞經歷了組蛋白總體丟失的改變,胞內出現局部和全局染色質重構,核內的組蛋白修飾出現不平衡,抑制性組蛋白修飾增多,進而導致整體轉錄水平的變化。然而,關于表觀遺傳改變如何具體調節衰老細胞的轉錄和基因表達,目前國內外可獲得的信息仍然有限。

為解決這一問題,王培昌團隊對兩種不同的細胞衰老模型進行多組學聯合分析,在不同分子層面上揭示衰老的景觀,識別在體內負責轉錄時間調控的關鍵元素。他們發現,當衰老發生時,衰老過程中的核層、異染色質和染色質連接被破壞,活性和非活性染色質結構域之間的界限變得模糊。

研究團隊進一步證實細胞衰老發生時轉錄噪聲升高,基因翻譯率下降,全局異染色質減少,以及核小體出現重構和丟失。發現細胞衰老中染色質可達性改變的區域總是集中于遠端基因間區、內含子區和啟動子區。一般來說,染色質從封閉狀態到開放狀態的切換導致基因激活。然而,遠端基因間區和內含子區注釋改變區域的增加,很可能直接導致基因表達噪聲的增加和基因翻譯率的下降。該研究還發現了ATP2C2、 BCAS3、CREG1等34個基因在衰老及其相關疾病中的關鍵作用,以及NAT1/PBX1/RRM2蛋白復合物的關鍵功能。

首都醫科大學宣武醫院宋喬博士生為該文第一作者,王培昌教授為獨立通訊作者。

關鍵詞: 衰老細胞

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