據中國農業科學院最新消息，該院北京畜牧獸醫研究所動物基因工程與種質創新團隊聯合北京相關生物企業等，成功繪制了梅山豬高質量基因組圖譜。這是迄今為止精度最高的亞洲豬基因組圖譜，為我國地方豬種質資源保護和開發利用奠定了基礎。相關成果發表于《分子生態資源(Molecular Ecology Resources)》。
項目負責人、中國農科院北京牧醫所周榮博士介紹，我國地方豬種具有肉質好、抗逆性強、耐粗飼等特點，是生豬種業持續創新和實現種源自主可控的良好素材。國內外學者針對我國地方豬種的抗病力、繁殖性能等重要經濟性狀的遺傳機制開展了大量研究，產生了海量重測序、轉錄組數據，分析研究這些數據需要與參考基因組進行比對;但目前豬功能基因組學研究大多利用西方豬種杜洛克的基因組序列，這在一定程度上限制了對亞洲家豬的基因組學研究。
團隊成功繪制了我國地方品種梅山豬的高質量基因組圖譜，contig N50和scaffold N50分別達到48.05 Mb和138.97 Mb，基因組大小為2.51Gb，共注釋到22074個編碼基因，是目前完整度最高、連續性最強的亞洲豬基因組圖譜。研究人員對梅山豬和杜洛克豬的基因組進行了比較分析，發現梅山豬基因組共存在49103個結構變異，其中4.02%是亞洲豬特有的結構變異。研究還發現亞洲豬X染色體上存在一個30 Mb的特有結構變異熱點，該熱點富集了與亞洲豬脂肪沉積、高繁殖力等特異性表型相關的基因。
該項研究得到國家自然科學基金重點項目、國家重點研發計劃等項目的支持。(記者 瞿劍)
關鍵詞： 亞洲豬參考基因組圖譜
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